自2006年以来，我校生态学科围绕三峡地区的生物资源保护及环境保护两个主题开展人才培养和科学研究工作，已成为在湖北省内较有研究特色和社会声誉的学科。
2006年，三峡大学开办湖北省首个生态学本科专业，同年获批生态学硕士学位二级授权点，2012年获批生态学硕士学位一级授权点。2006年11月，三峡大学生态学科被评为湖北省重点学科，2010被评为湖北省特色学科；在第3、4、5轮的全国学科评估中，本学科均为上榜学科，2017年~2020年本学科被三峡大学列为申报博士学位授权一级学科点的建设学科。
本学科拥有一支学术水平较高，年龄和职称结构合理的教师队伍。本学科有专任教师近20人，其中教授6人，副教授6人，16人具有博士学位。另外，本学位点从外学院和外单位聘请兼职学术型导师5人，行业导师13人；获批湖北省产业教授岗位1个，多人获批“楚天学子”称号。本学科拥有湖北省三峡地区生态保护与治理国际联合研究中心、三峡库区生态环境教育部工程研究中心、三峡大学生物教学实验省级示范中心、湖北省正江环保科技有限公司研究生工作站、湖北省神农架自然保护区研究生工作站地等科研教学平台。
近5年来，本学科围绕神农架地区动植物互作与生物多样性保护、三峡库区的山水林田湖治理等领域积极开展科研工作，团队承担了22项国家自然科学基金等国家级项目以及60余项其它科研项目，科研经费达4000余万元；发表高水平研究论文近160篇，获批专利10余项。
2006年以来，本学科共培养生态学本科和硕士人才近400人，毕业生进入各级生态环境局、林业局及其它企、事业单位从事管理与研究工作，人才培养质量受到用人单位的高度认可。
1、植物生态学
植物生态学主要研究三峡区域植物多样性的编目、分布格局与维持机制，人为活动干扰下植物多样性的内在变化机制与规律，珍稀濒危物种的濒危机理与保护方法等。聚焦秦巴山区、武陵山区和三峡地区珍稀濒危植物的生态保护，揭示物种濒危机制，创新种群恢复技术，为珍稀濒危物种的生态保护提供技术支持和科学依据。
2、生态系统生态学
生态系统生态学主要研究人为干扰和气候变化情景下土壤食物网的响应及其对生态系统过程的调节和反馈机制，以及物种互作与生态系统功能的分异规律和稳定性机制。聚焦草地和森林生态系统物种互作在生物多样性和生态系统功能的维持和作用机制，推进土壤生态恢复和生物多样性保护研究，服务于国家生态安全与文明建设的长期战略。
3、修复生态学
主要开展水利水电工程修建等人为因素引起的污染水体与工程边坡生态修复的研究。主要研究三峡库区水体-库岸带连续体的退化过程与形成机制，植被恢复先锋物种和治污功能树种的生态学特性，探究先锋群落的构建与调控等退化生态系统生态恢复的原理；研究水体微生态污染物的降解机理，研发修复水体污染的关键技术，为流域环境管理和生态环境恢复提供科学依据。
