制药工程专业在2022年获批国家级一流本科专业，2015年入选湖北省战略性新兴（支柱）产业人才培养计划，2016年入选湖北省生物医药类荆楚卓越人才协同育人计划，2017年获批招收药学专业学位硕士。
本专业培养掌握系统的现代药学和工程学的基础知识和基本技能，德、智、体、美、劳全面发展的应用型制药工程专门技术人才。学生毕业后，具有良好的创新创业意识、职业道德和一定的国际视野，具备分析、解决化学制药、中药制药及药物制剂等领域的复杂工程问题的能力，成为从事制药及相关行业的工艺与工程设计、技术和产品研发、生产管理与技术服务等工作的工程科学与技术人才。
本专业以“中国制造2025”为指引，立足三峡区域生物医药千亿产业，按照工程教育专业认证标准进行建设,建设省精品资源共享课程等一批金课，与宜昌市生物产业园共建省级示范实习实训基地，实施“三维度”实践教育体系的教学改革，与企业共同实行“一体化•五共同”的产业人才培养，在全国大学生制药工程设计大赛、化工设计大赛、生命科学创新创业大赛中连续获得一等奖、二等奖，考研上线率>38%，多名同学保送至华中科技大学、华东理工大学等名校深造，毕业生供不应求，深受人福药业、华海药业、药明康德等大型药企的欢迎。
